Seria interessante que você informasse também a Resolução e o Frame Rate dos AVIs que deram problema (use o programa MediaInfo).
Vale a pena também tentar repetir o processo com a opção Full Screen marcada.
Vamos à primeira parte:
Arquivos que funcionam com a legenda embutida:Arquivo X:Vídeo
ID : 0
Formato : MPEG-4 Visual
Perfil do Formato : Simple@L3
Conf do Formato, BVOP : Não
Conf do Formato, QPel : Não
Conf do Formato, GMC : Sem warppoints
Conf do Formato, Matriz : Default (H.263)
ID do Codec : DIVX
ID do Codec/Informações : Project Mayo
ID do Codec/Dica : DivX 4
Duração : 45mn 10s
Taxa de bits : 956 Kbps
Largura : 624 pixels
Altura : 464 pixels
Proporção da imagem : 4/3
Taxa de quadros : 23.976 fps
Resolução : 24 bits
Colorimetria : 4:2:0
Tipo de Scan : Progressivo
Bits/(Pixels*Quadros) : 0.138
Tamanho da Faixa : 309 MiB (86%)
Título : Video
Biblioteca usada : XviD 0.0.12 (UTC 2003-06-11)
Knight Rider Vídeo
ID : 0
Formato : MPEG-4 Visual
Perfil do Formato : AdvancedSimple@L5
Conf do Formato, BVOP : Sim
Conf do Formato, QPel : Não
Conf do Formato, GMC : Sem warppoints
Conf do Formato, Matriz : Default (H.263)
Modo de Multiplexação : Packed bitstream
ID do Codec : XVID
ID do Codec/Dica : XviD
Duração : 41mn 56s
Taxa de bits : 1 014 Kbps
Largura : 624 pixels
Altura : 352 pixels
Proporção da imagem : 16/9
Taxa de quadros : 23.976 fps
Resolução : 24 bits
Colorimetria : 4:2:0
Tipo de Scan : Progressivo
Bits/(Pixels*Quadros) : 0.193
Tamanho da Faixa : 304 MiB (87%)
Biblioteca usada : XviD 1.1.2 (UTC 2006-11-01)
Arquivos que não funcionam com a legenda embutida:FringeFormato : MPEG-4 Visual
Perfil do Formato : AdvancedSimple@L5
Conf do Formato, BVOP : Sim
Conf do Formato, QPel : Não
Conf do Formato, GMC : Sem warppoints
Conf do Formato, Matriz : Default (H.263)
ID do Codec : DIVX
ID do Codec/Informações : Project Mayo
ID do Codec/Dica : DivX 4
Duração : 1h 20mn
Taxa de bits : 1 076 Kbps
Largura : 624 pixels
Altura : 352 pixels
Proporção da imagem : 16/9
Taxa de quadros : 23.976 fps
Resolução : 24 bits
Colorimetria : 4:2:0
Tipo de Scan : Progressivo
Bits/(Pixels*Quadros) : 0.204
Tamanho da Faixa : 619 MiB (88%)
Título : Video
Biblioteca usada : XviD 1.2.0.dev47 (UTC 2006-11-01)
MentalID : 0
Formato : MPEG-4 Visual
Perfil do Formato : AdvancedSimple@L5
Conf do Formato, BVOP : Sim
Conf do Formato, QPel : Não
Conf do Formato, GMC : Sem warppoints
Conf do Formato, Matriz : Default (H.263)
ID do Codec : XVID
ID do Codec/Dica : XviD
Duração : 42mn 28s
Taxa de bits : 1 006 Kbps
Largura : 624 pixels
Altura : 352 pixels
Proporção da imagem : 16/9
Taxa de quadros : 23.976 fps
Resolução : 24 bits
Colorimetria : 4:2:0
Tipo de Scan : Progressivo
Bits/(Pixels*Quadros) : 0.191
Tamanho da Faixa : 306 MiB (87%)
Biblioteca usada : XviD 1.2.1 (UTC 2008-12-0