Jefferson, 
05 de agosto de 2011, 
Por um tempo, distros Linux de manutenção como o Clonezilla e o Parted Magic vinham com um arquivo “makeboot.bat” muito conveniente que permitia a criação de um pendrive de boot com a distro simplesmente copiando os arquivos para ela e rodando o batch.
Aparentemente os vários avisos de que makeboot.bat jamais deveria ser rodado em um HDD não surtiram efeito (não me surpreende), porque os mantenedores dessas distros removeram esse recurso. Ainda é possível criar os pendrives de boot, mas agora você precisa baixar um programa especializado, que simplesmente não deixa você escolher um disco que não seja removível: o TuxBoot:
Eu precisei testar o Clonezilla e o Parted Magic hoje. Com a ajuda do tuxboot não precisei ter que gravar CDs, o que seria duplamente inconveniente porque minha máquina alvo (um notebook) não tem drive de CDROM.
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Houve um período intermediário em que era recomendado o Unetbootin:
http://www.google.com/buzz/117578158927571476541/AUyqokzZKZg
Não sei por que decidiram criar o Tuxboot, mas provavelmente o Unetbootin falhava em alguma coisa.